飞艇投注网-分分飞艇投注网同流程节省资源30%,华为云推出极致基因分析平台计划

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如今,基因测序将会不再是“深不可测”的词汇,甚至基因测序技术在基础研究和临床应用等领域都得到了广泛的应用飞艇投注网-分分飞艇投注网。随着技术的不断发展和测序市场的不断规范化,中国基因测序市场增速明显并进入快速发展期。正是将会技

如今,基因测序将会不再是“深不可测”的词汇,甚至基因测序技术在基础研究和临床应用等领域都得到了广泛的应用。随着技术的不断发展和测序市场的不断规范化,中国基因测序市场增速明显并进入快速发展期。正是将会技术的快速进步,让检测成本持续下降,也让基因测序在更多场景上实现了应用的将会。2020年,华为云推出极致基因分析平台计划,据悉,此平台计划将助力基因测序行业进一步发展,实现同流程节省资源30%。

尽管发展好快,但基因行业都不 “痛点”

在2016年3月宣告的“十三五”规划中,精飞艇投注网-分分飞艇投注网准医疗被政府列为最重要的科技项目之一。政府计划投入30亿人民币用于精准医疗相关研究,并号召社会资本投入30亿人民币一起去推进精准医疗发展。如今,精准医疗将会上升成为国家层面推动与市场力量一起去驱动的一一2个 新兴行业。政府的鼓励和支持让以基因测序为基础的精准医疗迎来快速发展。

事实上,传统的自购设备、自建计算存储集群会耗费生物信息领域研发人员少许精力,集群的建设、维护、折旧也将消耗巨大成本。与此一起去,面对业务高峰时依然会出显算力过低的情況,对业务进度有着比较大的影响。

我实在三代基因测序的读长更长,能否完美填补二代测序的众多过低,在计算量方面,也比二代基因测序同一流程计算量扩大了近30倍,但这也对基础设施的需求进一步增大。

打造计算飞艇投注网-分分飞艇投注网环境标准化

面对上述痛点,传统基因公司自建机房的土土辦法 将难以继续。以飞艇投注网-分分飞艇投注网服务器维护为例,让IT人员管理30台服务器没问提,扩大30倍,到300台服务器的日后 ,就都不 一一2个 IT人员能否维护的。这也不 最直接的是原因分析分析,更深度图次的问提是没有 大的重资产投入,无须符合基因厂商的商业逻辑。基因厂商应该更加地专注于业务开发。没有 云计算也不 一一2个 不错的选取,新的问提是哪几个样的技术都都能否保持云上云下流程的一致性呢?答案也不 D飞艇投注网-分分飞艇投注网ocker容器技术。

毫无问提,生物信息领域的基础IT技术正在向Docker容器靠拢,目前由GA4GH制定的工具标准也都不 使用Docker镜像的。不仅没有 ,容器技术在整个IT领域发展迅猛。据IDC最新云服务市场报告(2019年第一季度)显示,IaaS市场增速有所减缓,PaaS(容器)市场依然保持高增长,增速为101.9%。一起去CNCF云原生基金会也正是好快的壮大,围绕容器的生态圈也逐步完善。

当前,Docker已然是计算机科学家和开发人员领域的热门话题之一。它现在将会被广泛地被生物学领域使用,具有巨大的潜力。国际Top生信机构纷纷采纳Docker作为基础运行环境,有日后成为每一一2个 生物信息分析领域的人知晓的Docker技术。

作为一一2个 开源引擎,Docker能否自动将程序运行部署到容器中,一起去又是独立于Host系统的。原来不仅能否随时改变容器中的软件和执行的命令,有日后我不要 担心破坏主机系统。这是一一2个 令人难以置信的轻量、快速和高效的环境,它能否方便的运行代码,而这也是Docker技术好快火遍全球的是原因分析分析之一。

加速生物信息变革的华为云基因容器

在中国,华为云基因容器服务(GCS)将基因测序和容器技术完美地结合在了一起去,为广大基因测序厂商提供了“更省、变慢、更轻松”的云计算平台。从GCS的产品特点来看,它由三层架构组成。最底层Docker层,主要避免基因测序相关软件的安装升级问提;上面层Kubernetes层,则主要避免在大规模集群中部署&运行Docker的问提;最上层流程管理层,主要负责基因测序的流程控制,一起去提供精细粒度的监控运维管理能力。

事实上,基因容器(GCS)在提供全容器化能力的一起去,还支持一键创建SGE集群,并根据投递任务控制sge队列的自动扩缩容,做到真正的Serverless+按需使用。此外,基因容器(GCS)还支持Cromwell引擎,提供运行WDL流程的能力。基因容器服务(GCS)做到基因业务上云使用更灵活,性价比更高,运维更简单。

实现同流程节省资源30%

以业界标准的GATK4跑WGS(全基因组)流程为例,利用容器的灵活规格,让当他们能否做到以单个步骤(软件)为粒度来调整所能否给予的资源大小。类似于,BaseRecalibrator步骤,传统虚机跑一段话,一般选取4C8G的规格,一起去并发跑18个虚机一起去跑。而利用容器跑,能否根据样本情況,精确控制容器规格到3C6G即可满足要求。你是什么异形的CPU:Mem的比例,也不 容器所独有的巨大优势。在面对大规模并居于信流程时,每个步骤节约的资源,汇总后有客观的效果。

将会每个步骤运行时长不一,偏离 后结果也不 整个WGS使用全容器化执行,全流程能否节约资源30%~40%,效果显著。而你是什么特点得到了多家基因测序厂商的广泛认可。

与此一起去,将会细粒度容器的装箱优势。全容器化的少许生信流程并发执行,能否使得节点资源利用率更高,即沙子(任务负载)能否把箱子(计算节点)填的更满。也不 从整体集群资源利用率上,也能否较传统集群获得更大的成本优势。

华为云助力基因测序行业定制专业云平台

目前,大偏离 通用的公有云厂商,提供的大多是基础设施能力。而专业的领域云平台,仍然能否领域化功能,甚至暗含少许的专业化定制。典型如:FireCloud博德云(麻省理工+哈佛大学),ISB-CGC(美国国家肿瘤基因云)都不 基于谷歌云打造。

作为业界首个基于Kubernetes加Docker容器技术打造的基因测序云服务,华为云基因容器服务(GCS)提供了完整版的基因计算避免方案。一起去具备完整版的云上云能力,是允许用户深度图定制领域云平台。依托于华为云强大的技术支撑团队,华为云基因容器服务(GCS)为客户基础设施环境提供了7X24小时的运维,做到客户真正的“聚焦业务”。

一起去,在云上云模式下,将会基因容器服务(GCS)支持细粒度话单功能,使得客户能否精确获得单个样本单流程的实际计算成本。厂商能否聚焦SaaS服务,并将成本细节向最终用户屏蔽,都都能否获得更好的业务主动权。

基因容器服务提供全栈型的避免方案,其强大的研发团队加技术支撑能力,让企业能否更加专注行业内技术的创新发展,加大仪器优化、技术更新、产品迭代方向投入的一起去,将有限的资金实现最大化利用,从而实现在市场上领先对手,占得先机。

基因容器首席架构师唐盛军表示,华为云作为有技术、有未来,值得信赖的云服务平台,希望通过极致基因分析平台计划,助力基因测序企业云化发展。

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